Prodhon nasceu em Besançon e era filho de um pequeno cervejeiro. Trabalhou como pastor e como aprendiz de impressor. Obteve uma bolsa para estudar mas perdeu-a em poucos anos por seu radicalismo político. Em 1848 foi eleito Deputado da Assembléia Nacional. O fracasso de todas suas propostas lhe fez abandonar as vias políticas oficiais e passar, então, a defender posturas anarquistas.
Considerava que o indivíduo é um ser imperfeito, de forma que qualquer reforma social requer a reforma moral do indivíduo. Segundo ele, a família e a propriedade familiar devem ser a base da economia. Defendia que o Governo, o crédito, os bancos e o dinheiro deveriam desaparecer.
Foi duramente criticado por Karl Marx na Miséria da filosofia.
Obras
What is Property?, 1840
"De la concurrence entre les chemins de fer et les voies navigables", 1845, Journal des economistes
De la célébration du dimanche, 1845
System of Economical Contradictions or The Philosophy of Misery, 1846.
Letters to Bastiat on Principal and Interest, 1849
General Idea of the Revolution in the Nineteenth Century, 1851
Du principe fédératif, 1863.
De la capacité politique des classes ouvrières, 1865
Les Évangiles, 1866
Jésus et les origines du christianisme, 1896
La royauté du peuple souverain, 1912